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植物統合生理学
発表論文
代表的な論文
Nakamichi N et al., "Chemical biology to dissect molecular mechanisms underlying plant circadian clocks"
New Phytologist 2022.
植物の時計を調節する もしくは影響を与える低分子化合物についての総説をまとめました。
Maeda AE and Nakamichi N. "Plant clock modifications for adapting flowering time to local environments"
Plant Physiology 2022, Focus IssueのEditorialはこちら.
今朝の朝食は何でしたか？ご飯の食べた方はprr7変異体イネを食べたでしょう。パンを食べた方はPRR7過剰発現コムギを食べたでしょう。PRR7を含めた時計遺伝子の変異は開花時期の調節のために選抜されています。これらの情報をまとめた総説です。
Uehara TN, Nonoyama T, Taki K et al., "Phosphorylation of RNA polymerase II by CDKC; 2 maintains the Arabidopsis circadian clock period"
Plant Cell Physiol. 2022, featured as first authors' profile, commentaryで紹介していただきました.
シロイヌナズナの時計周期を延長する化合物を発見し、さらにこの化合物の作用機序を探ることで、タンパク質リン酸化酵素（CDKC）による基本転写因子Pol IIのリン酸化が適切な時計周期調節に必要であることを報告した。
Uehara TN, Mizutani Y et al., "Casein Kinase 1 family regulates PRR5 and TOC1 in the Arabidopsis circadian clock"
PNAS 2019, featured in F1000 Prime.
シロイヌナズナの時計周期を延長する化合物を発見し、さらにこの化合物の作用機序を探ることで、タンパク質リン酸化酵素（カゼインキナーゼ1）が時計転写因子TOC1とPRR5をリン酸化することを報告した。
Ono A et al., "3, 4-dibromo-7-azaindole modulates Arabidopsis circadian clock by inhibiting Casein Kinase 1 activity"
Plant Cell Physiol. 2019, featured as first authors' profile.
シロイヌナズナの時計周期を延長する化合物を12,000化合物のライブラリーからスクリーニングし、その作用機序を解析した。
この化合物もカゼインキナーゼ１の活性を阻害することを見出した。
Saito AN et al., "Structure-function study of a novel inhibitor of the Casein Kinase 1 family in Arabidopsis thaliana"
Plant Direct 2019, featured as first author profile.
Uehara et al., PNASで見出された長周期化化合物の構造活性相関研究を行い、植物カゼインキナーゼ１に対する強力な阻害剤を開発した。
Kamioka M et al., "Direct repression of evening genes by CIRCADIAN CLOCK-ASSOCIATED 1 in the Arabidopsis circadian clock"
Plant Cell 2016
明け方に発現する時計転写因子（CCA1タンパク質）が直接的に制御する遺伝子群をゲノムワイドな解析（ChIPseq）から明らかにした。CCA1の標的遺伝子には、乾燥ストレス耐性に関わる遺伝子や転写因子をコードする遺伝子が頻出していた。
Nakamichi N "Transcriptional repressor PRR5 directly regulates clock-output pathways"
PNAS 2012, featured in F1000 Prime.
主に午後に発現する時計転写因子（PRR5タンパク質）が直接的に制御する遺伝子群をゲノムワイドな解析（ChIPseq）から明らかにした。PRR5の標的遺伝子には、花成・細胞伸長・低温ストレス耐性に関わる遺伝子が多く見られた。
Nakamichi N et al., "PSEUDO-RESPONSE REGULATORS 9, 7, and 5 are transcriptional repressors in the Arabidopsis circadian clock"
Plant Cell 2010, featured in F1000 Prime.
PRR9, PRR7, PRR5タンパク質の分子としての働きは長らく不明であった。この論文ではこれらPRRタンパク質が転写抑制因子として働くこと、またPRRタンパク質は明け方時計遺伝子のCCA1, LHYの転写を直接抑制することを見出した。
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